Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf138rt1Q9D9M9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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