Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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