Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ifi35Q9D8C4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ifi35Q9D8C4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms