Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rep15Q9D7T1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rep15Q9D7T1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rep15Q9D7T1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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