Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms