Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc94Q9D6J3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms