Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms