Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce1Q9D495 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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