Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms