Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms