Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx17Q9D0I4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms