Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Utp11Q9CZJ1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms