Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
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