Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms