Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms