Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tdrd12Q9CWU0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tdrd12Q9CWU0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tdrd12Q9CWU0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tdrd12Q9CWU0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tdrd12Q9CWU0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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