Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot11Q9CWN7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cnot11Q9CWN7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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