Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms