Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms