Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms