Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ergic3Q9CQE7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms