Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms