Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Rpl39lQ9CQD0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Rpl39lQ9CQD0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Rpl39lQ9CQD0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Rpl39lQ9CQD0 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Rpl39lQ9CQD0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Rpl39lQ9CQD0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl39lQ9CQD0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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