Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms