Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms