Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup155Q99P88 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms