Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf3b1Q99NB9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sf3b1Q99NB9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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