Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd1Q99MV1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms