Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms