Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms