Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nus1Q99LJ8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms