Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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