Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms