Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klhl22Q99JN2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms