Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms