Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thumpd1Q99J36 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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