Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NifkQ91VE6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms