Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cabp4Q8VHC5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms