Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SelenomQ8VHC3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms