Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Vmn1r200Q8R281 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r200Q8R281 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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