Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms