Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms