Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Afg3l2Q8JZQ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Afg3l2Q8JZQ2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Afg3l2Q8JZQ2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Afg3l2Q8JZQ2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Afg3l2Q8JZQ2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Afg3l2Q8JZQ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.8 ms