Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Neurl3Q8CJC5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms