Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LgsnQ8CIX8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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