Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms