Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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