Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms