Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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