Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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